ImageJ – программа для анализа и обработки графических файлов. Программа способна эффективно проанализировать изображение и получить подробные технические данные. ImageJ поддерживает большинство графических форматов и обладает набором инструментов для редактирования. Программа позволяет осуществлять разные геометрические преобразования, создавать гистограммы плотности, проводить 3D визуализацию, выполнять логические и арифметические операции между изображениями и тому подобное. ImageJ способна одновременно работать с множеством изображений, применять разные фильтры и проводить пакетную обработку файлов. ImageJ содержит множество плагинов, которые значительно расширяют возможности программы.